良好棉花发展标准BCI与有机棉最大不同就在于种植和生产方面。

    良好棉花生产原则是培养农民就如何合理使用化肥和农药等形成正确的操作规范，降低对作物和土壤的破坏，有效利用水资源，增强劳动者劳动保护意识，维护正当的劳动者权等。

    而有机棉的种植、生产标准完全不同于良好棉花，有机棉需要对土地进行认证，由常规生产过渡到有机生产。需要有转换期，一般为3年。不允许使用转基因种子，不允许使用任何化肥和农药，对水资源的使用无要求。

    全供应链的良好棉花供应链监管模式是由实物分隔堆放及加工供应链监管模式和进出库平衡供应链监管模式组成的。

    这是一种基于数量的管理追溯系统。实际数量的实物良好棉花无须伴随相应数量的BCCUs额度的申报。

    就是在轧花厂环节之后适用的进出库平衡模式并不要求BCCU继续与最初来自获得许可的BCI棉农的实物良好棉花有任何关系。这就意味着棉制品销售时能分配一定数量的良好棉花额度(与BCCU关联)，但不一定包含任何实物的良好棉花皮棉原料。

    实物分隔堆放及加工供应链监管模式，在棉田和轧花厂层面，良好棉花和普通棉花在采收、储存、运输和加工的所有各个阶段都必须保持分隔。普通棉花和良好棉花不得互相混合或替代。良好棉花必须明确标识(如使用标示牌和记录)。轧花厂销售的所有良好棉花皮棉必须100%由来自获得许可的BCI棉农(按照良好棉花原则及标准生产)种植的棉花生产所得，并且，必须能够追溯到获得许可的BCI棉农。轧花厂"在BCP平台申报的良好棉花皮棉销售总重量必须与购买的良好棉花籽棉总数量折合衣份率后相匹配。

    这是一种实物追溯的系统。任何BCCUs额度的申报都必须伴随实际数量的实物良好棉花。

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